科研服务一种新的冠心病诊断Biomark

在医院里，各个科室的就诊人数在不同的时间段都是不同的，但是有一个科室，无论什么时候都门庭若市，永远是排着长队——这就是心血管病科。冠状动脉粥样硬性心脏病（CAD）对于公共健康具有重大的影响，据世界卫生组织（WHO）年统计，年全世界范围内，心血管疾病是非传染性疾病死亡的主要原因，冠心病因其在世界范围内的高发病率和死亡率对人群健康和社会经济造成了很大的负担。

冠心病病人中，很大一部分往往在出现了胸痛、心衰等明医院就诊，被确诊时冠脉已经明显狭窄或闭塞，延误了最佳的干预时机，因此冠心病的早期诊断，对于其治疗就显得尤为重要。

1月3日，郑州大医院心血管内科李牧蔚教授课题组在ScientificReports杂志发表了研究论文，报道发现环状RNAhsa_circ_可用于冠状动脉疾病的诊断。

研究背景

现有的研究表明circRNA与肿瘤，心肌肥大引起的心衰，肺纤维化，肌强直营养不良，阿尔兹海默病等诸多疾病均有着密切的关系。

郑州大医院李牧蔚教授课题组的赵振舟和李雪洁等研究者，采用博奥晶典人类环状RNA芯片v2筛选得到冠心病病人外周血中表达明显升高的circRNA，并研究了circRNA作为冠心病的诊断标志物的灵敏度和特异性，对于冠心病的诊断和治疗提供了新的思路。

?技术路线

研究结果

1.博奥晶典人类环状RNA芯片v2高通量筛选circRNA

研究者选择了临床和统计学特征相匹配的12个对照组个体和12个冠心病组患者，取全血，用博奥晶典人类环状RNA芯片v2对全血中的circRNA表达分析，结果发现两组共有22个circRNA有差异性表达，其中在冠心病患者血液中表达上调的有12个，表达下调的有10个。

2.qPCR验证芯片结果

按p＜0.01筛选共得到5条circRNA，本研究在另外一个独立队列（对照组,n=30;冠心病组,n=30）中通过qPCR对其进行了验证，最后得到的结果与微阵列分析结果相符，与在对照组外周血中的表达量相比，这5个circRNA在冠心病组中的表达量均明显提高。

3.差异表达circRNA的ROC分析

为了比较这5个候选的circRNA对冠心病的临床诊断能力，研究者分别对其进行了ROC分析，结果如下图，其中hsa_circ_的灵敏度和特异度最高，分别为：86.7%和76.7%。

4.在独立临床样本中验证circRNA-biomarker

为了测试所hsa_circ_的实际诊断价值，在另一个独立队列（名对照组个体，名冠心病组个体）中进行验证。结果显示hsa_circ_在冠心病组的表达水平明显上调，ROC分析表明其AUC为0.（[0.-0.],p＜0.，灵敏度为0.，特异度为0.）。在将糖尿病，吸烟，低密度，胆固醇，高血压这些冠心病的危险因素加入之后，AUC轻度的提升到了0.（[0.-0.],p＜0.)，表明了较好的诊断价值。

研究结论

近期的明星RNA分子，circRNAs，已被证实参与了多种疾病的的病理过程，但是冠心病患者外周血中circRNA的表达特点，以及是否存在可作为诊断冠心病biomarker的circRNA，目前尚未经证实；本研究通过前期高通量circRNA芯片筛选和后续大量临床样本的有力验证，确定Hsa_circ_在临床的确有潜力，可作为冠心病诊断的biomarker。本研究选出的circRNAbiomarker，具有取材方便，费用低廉，有较高的诊断价值和方便、快捷的诊断流程等优点。

文献信息

ZhaoZ,LiX,GaoC,etal.PeripheralbloodcircularRNAhsa_circ_canbeusedasadiagnosticbiomarkerofcoronaryarterydisease[J].ScientificReports,,7:.（IF=5.）

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博奥晶典人类环状RNA芯片v2

为了帮助广大科研工作者对circRNA更好地研究，北京博奥晶典生物技术有限公司在人类环状RNA芯片v1的基础上全新升级为v2，该芯片是目前国内外市场检测circRNA数量最多的芯片，便于研究者对不同生理和病理状态下circRNA的表达变化进行系统研究，如进行疾病biomarker研究、功能研究、与mRNA、miRNA相互作用。

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芯片特点

?circRNA数量多芯片全面覆盖Circbase，Deepbase等数据库，检测circRNA数量达到,种，是国内和国外市场上检测数量最多的芯片。

?探针的特异性强芯片探针覆盖circRNA反向剪切位点，特异性高。一般情况下，该位点的序列不存在于基因组DNA和线性RNA分子中。

?芯片检测效率高芯片探针的靶向检测与二代测序的随机测序相比具有更高的检测效率。一次芯片实验检测circRNA数量远高于常规转录组测序（5-10G数据量）。

?芯片的准确性好芯片开发过程中的测试结果表明，高达74%的差异circRNA能得到定量PCR验证支持。

博奥晶典circRNA芯片产品

芯片

名称

circRNA

来源

circRNA

数量

芯片

格式

芯片检测

数量

博奥晶典人类环状RNA芯片v2

Circbase

Deepbase

MolCel,

92,

,

65,

4xK

,

(单探针)

博奥晶典小鼠环状RNA芯片v1

Circbase

MolCel,

GenBio,

GenBio,

NatNeurosci,

1,

15,

2,

7,

28,

8x60K

30,

(双探针)

博奥晶典大鼠环状RNA芯片v1

NatNeurosci,

18,

4x44K

18,

(双探针)

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